Bio-Informaticus Experimentele Pathologie Research

Wat ga je doen

Als bio-informaticus binnen ons onderzoeksteam ontwikkel en implementeer je bio-informatica-tools en -workflows voor het analyseren van grootschalige omics-data (DNA, RNA, single-cell). Je werkt in een multidisciplinair team aan het verbeteren van data-analyseprocessen en draagt bij aan wetenschappelijk onderzoek binnen de afdeling Pathologie en Medische Biologie.

• Je ontwikkelt, onderhoudt en optimaliseert workflows voor de analyse van omics-data, inclusief preprocessing, kwaliteitscontrole, integratie van databronnen en interpretatie van resultaten.
• Je ondersteunt onderzoekers bij het analyseren en interpreteren van complexe datasets, en draagt bij aan het opzetten van reproduceerbare en efficiënte analysemethoden.
• Je werkt mee aan het verbeteren van de data-infrastructuur, met aandacht voor veilige opslag, toegankelijkheid en naleving van privacy- en regelgeving (FAIR data principes).
• Je denkt actief mee over methodologische keuzes binnen onderzoeksprojecten en draagt bij aan publicaties en wetenschappelijke output.
• Je draagt bij aan kennisdeling binnen het team door het geven van praktische ondersteuning en training aan collega’s, en neemt deel aan interdisciplinair overleg binnen de afdeling.
• Je krijgt ruimte voor eigen initiatief en het inbrengen van innovatieve ideeën die bijdragen aan de verdere ontwikkeling van bio-informatica binnen het UMCG.

Werkomgeving

De toekomst van diagnostiek en onderzoek ligt in data. Binnen het UMCG werken we met steeds grotere en complexere genomics datasets om diepgaand inzicht te krijgen in ziekteprocessen. Als bio-informaticus binnen ons team speel jij een sleutelrol in het vertalen van deze data naar betekenisvolle inzichten die bijdragen aan wetenschappelijke doorbraken en uiteindelijk aan betere zorg.

Je komt te werken bij de afdeling Pathologie en Medische Biologie, waar we in een dynamische en multidisciplinaire omgeving onderzoek doen naar moleculaire en cellulaire mechanismen van ziekten, waaronder kanker. Samen met een groeiend team van bio-informatici en computationele biologen bouw je aan een robuuste infrastructuur voor dataopslag en -analyse. Je werkt met DNA-, RNA- en single-cell datasets uit klinische studies en experimentele modellen, en draagt bij aan het vindbaar, toegankelijk, herbruikbaar en interpreteerbaar maken van deze data volgens de FAIR-principes. Daarnaast beweeg je je in een complex speelveld van wet- en regelgeving en institutionele kaders, waarin je meedenkt over duurzame en veilige oplossingen voor dataverwerking. Je werkt mee aan toonaangevende nationale en internationale onderzoeksconsortia en draagt bij aan innovaties in diagnostiek en gepersonaliseerde geneeskunde.

Wat vragen wij

• Een afgeronde hbo- of wo-opleiding in bio-informatica, data science, (toegepaste) informatica, biotechnologie of een vergelijkbare richting.
• Aantoonbare ervaring met de analyse van grootschalige omics-datasets, zoals genomics, transcriptomics, proteomics of epigenomics, bij voorkeur in een onderzoekscontext.
• Vaardigheid in programmeertalen zoals Python en/of R, en ervaring met het automatiseren van dataverwerking.
• Bekendheid met FAIR data principes en datastandaarden binnen wetenschappelijk onderzoek.
• Goede beheersing van zowel de Nederlandse als de Engelse taal, in woord en geschrift.
• Je bent analytisch sterk, werkt gestructureerd en beschikt over goede sociale en communicatieve vaardigheden.
• Je hebt een proactieve houding, toont initiatief en kunt zowel zelfstandig als in teamverband werken.
• Je hebt een duidelijke affiniteit met wetenschappelijk onderzoek en bent gemotiveerd om bij te dragen aan publicaties, methodologische ontwikkeling en innovatie binnen het vakgebied.

Daarnaast is het een pré als je:

• Ervaring hebt met workflowmanagers zoals Snakemake of Nextflow.
• Kennis hebt van wet- en regelgeving rondom het verkrijgen, verwerken, delen en opslaan van persoonlijke data (data stewardship).
• Affiniteit hebt met privacyaspecten van persoonlijke en genetische data.
• Ervaring hebt met IT-systeembeheer, het gebruik van Docker, en versiebeheer via Git.
• Bekend bent met de toepassing van machine learning-methoden in bio-informatica.

Wat bieden wij

Het UMCG is een boeiende en dynamische omgeving met doorgroeimogelijkheden, mogelijkheid tot hybride werken en je maakt deel uit van een gemotiveerd team van Bio-Informatici en KMBP binnen een enthousiaste, multidisciplinaire en zeer gewaardeerde afdeling. Wij bieden je in eerste instantie een contract voor een jaar, 32-36 uur per week. (Voor interne kandidaten met een vast dienstverband kan hiervan worden afgeweken). Bij gebleken geschiktheid wordt de aanstelling omgezet in een vast dienstverband. Het salaris wordt bepaald aan de hand van opleiding en ervaring. Je pensioen wordt opgebouwd bij het ABP, UMCG draagt 2/3e deel van deze premie bij. Daarnaast biedt het UMCG 8% vakantietoeslag en 8,3% eindejaarsuitkering. De arbeidsvoorwaarden zijn conform de CAO Universitair Medische Centra (CAO-UMC).

Voor vragen over de functie

Niet jouw vacature?