Vacatures

HPC cloud Linux admin/devops met interesse in bioinformatica

Opleiding:
HBO
29 - 36 uur per week
Salaris:
€2911 - €4615

Reageer t/m 11 August

Geplaatst op

Werkomgeving

Wij zijn het Genomics Coordination Center (GCC); de ‘big data’ en bioinformatica research & service hub van het Universitair Medisch Centrum Groningen (UMCG). Ontwikkelingen gaan snel in de levenswetenschappen met grote biobanken en nieuwe moleculair biologische technieken, die terabytes aan genotype en fenotype profielen opleveren. Dit biedt ongekende mogelijkheden voor het voorspellen van ziekte en gezondheid, maar ook grote uitdagingen in het delen, (her)gebruiken en analyseren van al deze nieuwe, maar vaak gevoelige data. Wij werken daarom met meer dan 40 collega’s in diverse lokale, nationale en EU projecten aan slimme software om mensgebonden onderzoek te versnellen en zorg te verbeteren. Daarvoor maken we open source web applicaties (zie website), analyse pipelines en grootschalige e-infrastructuur (HPC clusters, parallel storage systems en cloud). Op deze manier draagt GCC in belangrijke mate bij aan het FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) maken van research data en wetenschappelijk onderzoek. Hierbij hanteren we een agile aanpak.

Functiebeschrijving

Wij zoeken een ervaren Linux admin of devop voor het functioneel beheer van onze zes HPC rekenclusters (1264 cores) en onze 8 OpenStack ‘cloud’ servers (110 VMs met Apache/Tomcat), on-premise en in the cloud. Dit behelst o.a. geautomatiseerd configuratie management, monitoring, het maken van verbetervoorstellen/roadmaps, het ontwerpen en inrichten van nieuwe systemen. Bij de uitrol van nieuwe technologieën ben je ook betrokken bij het onderwijs om collega’s in te werken op die technologie. Je ondersteunt een groep van primaire gebruikers van de infra die je beheert. Dit zijn aan de ene kant bioinformatici, met als missie grootschalige DNA en RNA data analyse ten behoeve van onderzoek en diagnostiek, en aan de andere kant software engineers, die webapplicaties maken voor analyse van wetenschappelijke en zorgdata. Verder werk je in nauwe samenwerking met sysadmins van het Centrum voor Informatie Technologie (CIT) van de Rijksuniversiteit Groningen alsmede de sysadmins van het UMCG, die al onze IT faciliteiten technisch beheren. Tot slot werk je samen met onze nationale en Europese samenwerkingspartners en heb je veel multidisciplinair contact met toponderzoekers, statistici, diagnostici en artsen.

Wat vragen wij

De ideale kandidaat:

  • is een bioinformaticus met een kloppend Linux-root hart met aantoonbare ervaring in professioneel beheer van HPC computer clusters en/of VM clouds;
  • is communicatief vaardig, klantvriendelijk en werkt nauwkeurig;
  • is gewend om te streven naar kwaliteitverbetering; bijvoorbeeld door te werken met versiebeheer, change management, standard operating procedures (SOPs), risico inventarisaties, certificeringstrajecten (ISO/NEN) en bijbehorende audits;
  • heeft goede mondelinge en schriftelijke uitdrukkingsvaardigheden;
  • kan zowel zelfstandig als in teamverband werken;
  • is initiatiefrijk en heeft een proactieve houding;
  • heeft een goede beheersing van de Nederlandse en Engelse taal in woord en geschrift.

We verwachten HBO of WO achtergrond (postdocs ook welkom). Ervaring met wetenschappelijk onderzoek of het werken in een academische omgeving is een pre. Kennis van SLURM, PBS, PostgreSQL, Apache, Elastic, R, python, bash, virtualisatie/cloud technologie, configuratie management tools (ansible, puppet, easybuild, etc), container technologie (Docker), firewalls, continuous delivery, etc, is een pre.

Het UMCG voert een preventief Hepatitis B beleid. Indien vereist voor de functie kan het UMCG de vaccinatie verzorgen.

Voor bepaalde beroepsgroepen wordt bij indiensttreding een Verklaring Omtrent Gedrag (VOG) gevraagd.

Wat bieden wij

Een arbeidsovereenkomst voor de duur van een jaar (0.8-1.0 fte), met kans op verlenging, in een boeiende omgeving en met ruimte om veel nieuwe kennis op te doen. Het salaris bedraagt maximaal € 4.615,- bruto per maand (schaal 10) afhankelijk van opleiding en ervaring en op basis van een fulltime dienstverband. Daarnaast biedt het UMCG 8% vakantietoeslag en 8,3% eindejaarsuitkering. De arbeidsvoorwaarden zijn conform de CAO Universitair Medische Centra (CAO-UMC).

Kandidaten met PhD titel bieden we daarnaast één 'onderzoeksdag', met ruimte voor co-supervisie van PhD studenten.

Meer informatie
Neem voor meer informatie contact op met:

  • dr. Pieter Neerincx, coördinator e-infrastructuur
  • dr. Gert-Jan van de Geijn, teamleider analyse team
  • prof.dr. Morris Swertz, hoofd Genomics Coordination Center

Allen bereikbaar via het secretariaat, telefoonnummer: (050) 361 7100.

Voor vragen over de functie

Als je vragen hebt over de inhoud van de functie, vinden we het leuk om van je te horen. Neem gerust contact op.

Solliciteren

Solliciteren kan uitsluitend via het digitale sollicitatieformulier onderaan deze pagina, tot en met 11 augustus 2020.
Binnen een half uur na het verzenden van het digitale sollicitatieformulier wordt een ontvangstbevestiging gemaild met nadere informatie.

Solliciteer

Heb je nog vragen?

We vinden het leuk als je contact met ons opneemt als je vragen hebt over werken bij het UMCG.

Vera Heijnen
Vera Heijnen Team Recruitment