Research analist Medische Biologie

Opleiding:
HBO
36 uur per week
Salaris:
€ 2.595 - € 3.675

Reageer t/m 14 augustus

Geplaatst op

Projectomschrijving

Voor het stellen van een goede diagnose en het bepalen van de optimale behandeling bij een patiënt met een afwijking die gezien wordt met beeldvormende technieken, is het nemen en de analyse van een biopt van het tumorweefsel een essentieel onderdeel van de pathologische diagnostiek. Daarnaast kan in bloedplasma van patiënten met kanker DNA afkomstig van de tumor gedetecteerd worden. De afdeling Pathologie van het UMCG onderzoekt in samenwerking met de afdeling Medische Oncologie of de analyse van circulerend tumor DNA van aanvullende waarde is op de huidige beeldvormende analyses om respons van de tumor op behandeling te meten, of bijdraagt aan de diagnose wanneer het nemen van een weefselbiopt niet mogelijk is. In dit project wordt het circulerend tumor DNA in plasma van patiënten in 2 verschillende klinische studies met innovatieve technieken onderzocht.

IMPACT-MBC
Dit betreft een cohort van patiënten met borstkanker van wie voor en na de start van de behandeling bloedplasma verkregen is. Uit dit plasma zal het circulerend DNA geïsoleerd worden waarop vervolgens een brede analyse naar mutaties uitgevoerd wordt met behulp van next generation sequencing. Hiermee kunnen niet alleen tumor-specifieke mutaties geïdentificeerd worden, maar ook de hoeveelheid daarvan. Deze resultaten worden vervolgens vergeleken met de uitkomsten van de beeldvormende analyses om te bepalen of de veranderingen in circulerend tumor DNA correleren met de klinische response (wel of geen afname van de tumorgrootte na start van de behandeling). Hiermee kan getoetst worden of een brede analyse van circulerend DNA een vroege en mogelijk betere voorspeller is van de respons op de behandeling dan de huidige standaard beeldvorming.

GALLOP-11
Dit betreft een cohort van patiënten met een gastro-intestinale stromacel tumor (GIST). Met 2 verschillende door ons ontwikkelde hoog sensitieve detectiemethoden (digital droplet PCR analyses en UltraSeek-MassArray mutatie assays) wordt onderzocht of de analyse van circulerend tumor DNA gebruikt kan worden voor de monitoring van de respons op behandeling. Hiervoor wordt gebruikt gemaakt van de kennis die we hebben van het DNA dat eerder geïsoleerd en geanalyseerd is uit het tumorweefsel. Door in het plasma specifiek naar deze DNA mutaties te zoeken, kan gezocht worden naar de spreekwoordelijke speld in de hooiberg en daarmee nog gevoeliger de therapierespons te meten aan de hand van veranderingen in circulerend tumor DNA. In dit onderzoek wordt getoetst of hoog gevoelige en mutatie-specifieke detectiemethoden vergelijkbare of betere voorspellers zijn voor respons op behandeling dan de huidige standaard beeldvorming.

Functieomschrijving

  • Je bent verantwoordelijk voor de verwerking en opslag van patiënten-materiaal dat verkregen wordt in het kader van de IMPACT-MBC en GALLOP studies.
  • Je voert ctDNA NGS analyse uit in het kader van de IMPACT-MBC studie.
  • Je valideert het UltraSeek-MassArray GIST mutatie panel voor de detectie van DNA mutaties in plasma.
  • Je voert ddPCR analyses uit ten behoeve van de GALLOP studie en ondersteunt andere centra in Nederland die deze analyses ook uit voeren in het kader van GALLOP.
  • Je bent verantwoordelijk voor de verslaglegging van de resultaten en beheer van databases van de IMPACT-MBC en GALLOP studie.

Afdeling

Naast de classificatie van tumoren door middel van histopathologisch onderzoek worden steeds meer moderne moleculair diagnostische onderzoeken verricht om te bepalen welke behandeling het best past bij elke individuele patiënt. Het verbeteren van de diagnostiek door ontwikkeling en validatie van innovatieve technologieën is een belangrijk speerpunt van het gezamenlijke onderzoeksprogramma’s van de afdelingen Pathologie en Medische Oncologie van het UMCG. Hiervoor beschikt het laboratorium voor Moleculaire Pathologie van de afdeling Pathologie over een groot aantal moderne faciliteiten en technologieën: een biobank van cel-vrij plasma van patiënten met longkanker, borstkanker en GIST, state-of-the-art apparatuur (ddPCR, UltraSeek-MassArray, kwantitatieve PCR) en is ruime moleculair biologische expertise voorhanden op het gebied van next-generation sequentieanalyse. Het laboratorium is een referentiecentrum voor moleculaire analyses en voert de complexe moleculaire diagnostiek uit voor patiënten met kanker uit Friesland, Groningen en Drenthe conform internationale kwaliteitsnormen (ISO15189). Ook de ontwikkeling en validatie van nieuwe moleculaire analyses wordt uitgevoerd onder deze kwaliteitsnorm.

Functie-eisen

  • Je hebt een afgeronde HLO-opleiding.
  • Je hebt ervaring met moleculair biologische technieken, zoals DNA isolatie en kwantitatieve PCR (zoals ddPCR en MassARRAY ULS).
  • Je hebt ervaring met het opwerken van plasma, primer design, ctDNA NGS analyse en het verwerken van grote hoeveelheden data.
  • Je kunt zelfstandig en in teamverband werken.
  • Je bent nieuwsgierig, enthousiast, kritisch en neemt initiatief.
  • Je bent goed in het behouden van overzicht en het maken van een goede werkplanning.
  • Je werkt nauwkeurig, netjes en je kunt onder tijdsdruk werken.
  • Je beschikt over uitstekende communicatieve vaardigheden.
  • Je hebt een flexibele werkhouding.
  • Je bent nauwkeurig en werkt conform ISO15189.

Het UMCG voert een preventief Hepatitis B beleid. Indien vereist voor de functie kan het UMCG de vaccinatie verzorgen.

Voor bepaalde beroepsgroepen wordt bij indiensttreding een Verklaring Omtrent Gedrag (VOG) gevraagd.

Arbeidsvoorwaarden

Het betreft een arbeidsovereenkomst voor de duur van een jaar (36 uur per week). Het salaris bedraagt maximaal € 3.675,- bruto per maand (schaal 7M) afhankelijk van opleiding en ervaring en op basis van een fulltime dienstverband. Daarnaast biedt het UMCG 8% vakantietoeslag en 8,3% eindejaarsuitkering. De arbeidsvoorwaarden zijn conform de CAO Universitair Medische Centra (CAO-UMC).

Voor vragen over de functie

Als je vragen hebt over de inhoud van de functie, vinden we het leuk om van je te horen. Neem gerust contact op.

dr. Léon van Kempen klinisch moleculair bioloog in de pathologie

prof. dr. Ed Schuuring klinisch moleculair bioloog in de pathologie

Solliciteren

Solliciteren kan uitsluitend via het digitale sollicitatieformulier onderaan deze pagina, tot en met 14 augustus 2022.
Binnen een half uur na het verzenden van het digitale sollicitatieformulier wordt een ontvangstbevestiging gemaild met nadere informatie.

Solliciteer

Niet jouw vacature?

Kijk of een open sollicitatie voor jou mogelijk is.

Heb je nog vragen?

We vinden het leuk als je contact met ons opneemt als je vragen hebt over het werken bij het UMCG.

Nina
Nina van Venrooij Team Recruitment