Functiebeschrijving
Lynch syndroom is de meest voorkomende erfelijke vorm van dikke darmkanker en is de oorzaak van 3% van alle nieuwe gevallen per jaar. Naar schatting heeft 1 op de 280 mensen in de algemene bevolking de aanleg voor Lynch syndroom. Lynch syndroom wordt veroorzaakt door een kiembaan mutatie in één van de mismatch-reparatie-genen (MMR-genen): MLH1, MSH2, MSH6 of PMS2. Deze genen zorgen voor het herstellen van somatische mutaties in het DNA die ontstaan als cellen zich gaan delen. Deze stapeling van mutaties kan uiteindelijk leiden tot het ontstaan van een tumor.
Inmiddels is bekend dat er 3 verschillende pathways kunnen leiden tot darmkanker in MMR-mutatiedragers. Er zijn aanwijzingen dat er voorkeurpathways zijn voor de verschillende MMR-genen. Dit project onderzoekt de directe gevolgen van MMR-deficiëntie in goedaardige voorstadium cellen door prospectief van MMR-mutatiedragers biopten van normaal weefsel en poliepen te verzamelen. Deze biopten zullen door de onderzoeker gekleurd worden op aanwezigheid van de MMR-eiwitten, met laserdissectie onderverdeeld en uiteindelijk gesequenced worden. Het resultaat zijn Gen- en Pathwayspecifieke profielen, die van belang zijn voor het vaststellen van surveillance beleid en voorspellers kunnen worden voor preventieve (vaccinatie) en (immuno-)therapeutische efficiëntie.
Als onderzoeker ben je betrokken bij alle aspecten van dit onderzoek: coördineren van de inclusie, data- en weefsel verwerking, DNA-sequencing en analyse. Onze groep werkt nauw samen met andere (inter)nationale onderzoeksgroepen en een (korte) buitenlandse stage behoort eventueel tot de mogelijkheden.
Het project is een directe samenwerking tussen verscheidene ziekenhuisafdelingen, namelijk de Maag- , Darm- en Leverziekten (UMCG, AMC, AVL en LUMC), de Pathologie (UMCG) en de Klinische Genetica (UMCG). De onderzoeker zal in eerste instantie voor 0,8 fte aangesteld worden bij de afdeling Genetica in het UMCG voor 1 jaar, wat daarna bij wederzijdse tevredenheid verlengd kan worden tot een volledig promotie traject. Het betreft een door het KWF gesubsidieerd onderzoek.